| 水系 | 河流(河段) | 所在区 | 现状水质类别 | 
| 永定河水系 | 永定河山峡段 (官厅坝下-三家店) | 门头沟 | Ⅱ | 
| 清水河 | 门头沟 | Ⅱ | |
| 清水涧 | 门头沟 | 无水 | |
| 永定河平原段 (三家店-崔指挥营) | 石景山、丰台、房山、大兴 | Ⅱ | |
| 高井沟 | 石景山 | Ⅱ | |
| 妫水河上段 (黄龙潭-京张公路桥) | 延庆 | Ⅲ | |
| 妫水河下段 (京张公路桥-官厅水库) | 延庆 | Ⅳ | |
| 新华营河 | 延庆 | Ⅱ | |
| 古城河 | 延庆 | Ⅱ | |
| 永兴河 | 大兴 | Ⅳ | |
| 大龙河 | 大兴 | Ⅳ | |
| 小龙河 | 大兴 | 无水 | |
| 潮白河水系 | 潮白河上段 (河槽-向阳闸) | 密云、怀柔、顺义 | Ⅲ | 
| 潮白河下段 (向阳闸-牛牧屯) | 顺义、通州 | Ⅲ | |
| 白河上段 (白河堡水库-密云水库) | 延庆、怀柔、密云 | Ⅱ | |
| 白河下段 (白河主坝-河槽) | 密云 | Ⅱ | |
| 黑河 | 延庆 | Ⅱ | |
| 天河 | 怀柔 | Ⅱ | |
| 汤河 | 怀柔 | Ⅱ | |
| 渣汰沟 | 延庆、怀柔 | Ⅱ | |
| 琉璃河 | 怀柔 | Ⅱ | |
| 白马关河 | 密云 | Ⅱ | |
| 潮河上段 (古北口-密云水库) | 密云 | Ⅱ | |
| 潮河下段 (潮河主坝-河槽) | 密云 | Ⅲ | |
| 牤牛河 | 密云 | 无水 | |
| 安达木河 | 密云 | 无水 | |
| 清水河 | 密云 | Ⅱ | |
| 红门川河 | 密云 | Ⅱ | |
| 沙河 | 怀柔、密云 | 无水 | |
| 怀河 | 顺义、怀柔 | Ⅲ | |
| 雁栖河 | 怀柔 | Ⅲ | |
| 怀沙河 | 怀柔 | Ⅱ | |
| 怀九河 | 怀柔 | Ⅱ | |
| 箭杆河 | 顺义 | Ⅳ | |
| 城北减河 | 顺义 | Ⅲ | |
| 运潮减河 | 通州 | Ⅳ | |
| 北运河水系 | 北运河 | 通州 | Ⅲ | 
| 温榆河上段 (沙河水库-沙子营) | 昌平、顺义 | Ⅲ | |
| 温榆河下段 (沙子营-北关闸) | 顺义、朝阳、通州 | Ⅲ | |
| 蔺沟 | 昌平 | Ⅱ | |
| 桃峪口沟 | 昌平 | Ⅳ | |
| 东沙河 | 昌平 | Ⅲ | |
| 北沙河 | 昌平、海淀 | Ⅲ | |
| 关沟 | 昌平 | 无水 | |
| 南沙河 | 昌平、海淀 | Ⅲ | |
| 清河上段 (安河闸-清河桥) | 海淀 | Ⅱ | |
| 清河下段 (清河桥-沙子营) | 昌平、朝阳 | Ⅱ | |
| 万泉河 | 海淀 | Ⅳ | |
| 小月河 | 海淀 | Ⅱ | |
| 坝河上段 (东直门-驼房营) | 朝阳 | Ⅳ | |
| 坝河下段 (驼房营-温榆河) | 朝阳 | Ⅳ | |
| 土城沟 | 海淀、朝阳 | Ⅱ | |
| 北小河 | 朝阳 | Ⅳ | |
| 亮马河 | 东城、朝阳 | Ⅳ | |
| 小中河 | 顺义、通州 | Ⅲ | |
| 通惠河上段 (东便门-高碑店闸) | 朝阳 | Ⅲ | |
| 通惠河下段 (高碑店闸-通济桥) | 朝阳、通州 | Ⅲ | |
| 南护城河 | 东城、西城 | Ⅱ | |
| 北护城河 | 东城、西城 | Ⅱ | |
| 长河 | 海淀、西城 | Ⅱ | |
| 永引上段 (三家店-罗道庄) | 石景山、海淀 | Ⅱ | |
| 永引下段 (罗道庄-广安门) | 海淀、西城 | Ⅱ | |
| 京密引水渠 | 密云、怀柔、顺义、昌平、海淀 | Ⅱ | |
| 昆玉河 | 海淀 | Ⅱ | |
| 二道沟 | 朝阳 | Ⅱ | |
| 凉水河上段 (万泉寺-大红门) | 丰台 | Ⅲ | |
| 凉水河中下段 (大红门-榆林庄) | 丰台、朝阳、大兴、亦庄、通州 | Ⅲ | |
| 莲花河 | 石景山、西城、丰台 | Ⅱ | |
| 新开渠 | 石景山 | Ⅱ | |
| 马草河 | 丰台 | Ⅱ | |
| 丰草河 | 丰台 | Ⅱ | |
| 小龙河 | 丰台、大兴 | Ⅲ | |
| 玉带河 | 通州 | Ⅳ | |
| 萧太后河 | 朝阳、通州 | Ⅲ | |
| 通惠北干渠 | 朝阳、亦庄、通州 | Ⅱ | |
| 西排干 | 朝阳、亦庄、通州 | Ⅲ | |
| 半壁店明渠 | 朝阳 | Ⅱ | |
| 观音堂明沟 | 朝阳 | Ⅲ | |
| 大柳树明沟 | 朝阳 | Ⅱ | |
| 凤河 | 大兴、亦庄 | Ⅴ | |
| 新凤河 | 大兴、亦庄、通州 | Ⅳ | |
| 黄土岗灌渠 | 丰台 | 无水 | |
| 港沟河 | 通州 | Ⅳ | |
| 凤港减河 | 大兴、亦庄、通州 | Ⅳ | |
| 大清河水系 | 小清河 | 房山 | Ⅲ | 
| 刺猬河 | 房山 | Ⅲ | |
| 长辛店明沟 | 丰台 | 无水 | |
| 大石河上段 (堂上-漫水河) | 房山 | Ⅱ | |
| 大石河下段 (漫水河-祖村) | 房山 | Ⅲ | |
| 丁家洼河 | 房山 | Ⅲ | |
| 东沙河 | 房山 | Ⅲ | |
| 周口店河 | 房山 | Ⅱ | |
| 马刨泉河 | 房山 | Ⅳ | |
| 拒马河 | 房山 | Ⅱ | |
| 夹括河 | 房山 | Ⅲ | |
| 蓟运河水系 | 泃河库上段 | 平谷 | Ⅱ | 
| 泃河上段 (罗汉石-平谷东关) | 平谷 | 无水 | |
| 泃河下段 (平谷东关-市界) | 平谷 | Ⅲ | |
| 将军关石河 | 平谷 | 无水 | |
| 黄松峪石河 | 平谷 | Ⅲ | |
| 洳河上段 (银野岭-岳各庄) | 平谷 | Ⅱ | |
| 洳河下段 (岳各庄-泃河) | 平谷 | Ⅲ | |
| 镇罗营石河 | 平谷 | Ⅲ | |
| 金鸡河 | 顺义、平谷 | Ⅲ | 

| 水质类别 | 适用范围 | 
| I类 | 主要适用于源头水、国家自然保护区 | 
| II类 | 主要适用于集中式生活饮用水地表水源地一级保护区等 | 
| III类 | 主要适用于集中式生活饮用水地表水源地二级保护区、渔业水域及游泳区 | 
| IV类 | 主要适用于一般工业用水区及人体非直接接触的娱乐用水区 | 
| V类 | 主要适用于农业用水区及一般景观要求水域 | 
| 劣V类 | 不符合上述水域水质要求,丧失使用功能 | 
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